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{{not|單核苷酸多態性}}
'''核苷酸多樣性'''（nucleotide diversity）是[[分子遺傳學]]（分子生物學）中的一個概念。該概念用於表徵某一[[種群]]中[[多態性 (生物學)|多態性]]的強弱<ref>
{{cite journal
|title=Mathematical Model for Studying Genetic Variation in Terms of Restriction Endonucleases
|journal=PNAS
|date=October 1, 1979
|first=
|last= |author2=Masatoshi Nei |author3=Wen-Hsiung Li
|volume=76
|issue=10
|pages=5269–73
|pmid=291943 |pmc=413122 
|url=
|doi=10.1073/pnas.76.10.5269
|author=Nei, M.}}
</ref>。

[[根井正利]]和[[李文雄 (生物學家)|李文雄]]在1979年引入了一種計算核苷酸多樣性的方法：在從某一種群中取得的多個樣品DNA上隨機取一段序列，將在這些序列上的同一位點鹼基的不同取平均值，即可得核苷酸多樣性的值。他們將這個值記爲「''π''」。

這種方法用數學公式表示如下：
: <math>\pi = \sum_{ij} x_i x_j \pi_{ij} = 2 * \sum_{i=1}^n \sum_{j=1}^{i-1} x_i x_j \pi_{ij}</math>

''x<sub>i</sub>'' 、''x<sub>j</sub>''分別代表第i個和第j個序列的對應頻率<ref group="註">比如一共擁有5個樣本，那麼''x<sub>i</sub>'' 、''x<sub>j</sub>''均爲1/5</ref>。''π<sub>ij</sub>''則爲兩個序列之間不同位點所佔百分比<ref group="註">舉個例子來說，假設第i個樣本的序列爲ATTAC，第j個樣本的序列爲ATTAT。進行比較可知，兩個序列的長度均爲5個鹼基對，其中有一對鹼基對在兩個樣本間是不同的，π<sub>ij</sub>爲1/5</ref>。n則爲總樣本數。

核苷酸多樣性是[[遺傳變異]]（genetic variation）的一個量化值。核苷酸多樣性通常與其他衡量種群多樣性的數值有聯繫，同時也和期望雜合度（expected heterozygosity）有聯繫。核苷酸多樣性通常用於衡量種群內或種群間的多樣性，或作物與相關物種間的遺傳變異<ref>{{cite journal
|title=Molecular diversity at 18 loci in 321 wild and 92 domesticate lines reveal no reduction of nucleotide diversity during Triticum monococcum (Einkorn) domestication: implications for the origin of agriculture
|journal=Molecular Biology and Evolution
|date=December 2007
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|last= |author2=Ozkan H |author3=Walther A |author4=Kohl J |author5=Dagan T |author6=Salamini F |author7=Martin W
|volume=24
|issue=12
|pages=2657–68
|pmid=17898361
|url=https://archive.org/details/sim_molecular-biology-and-evolution_2007-12_24_12/page/2657|doi=10.1093/molbev/msm192
|author=Kilian, B}}</ref>。另外，核苷酸多樣性還可以用於推算進化關係<ref>{{cite journal
|title=Nucleotide diversity in gorillas
|journal=Genetics
|date=March 2004
|first=
|last=
|author2=Jensen-Seaman MI
|author3=Chemnick L
|author4=Ryder O
|author5=Li WH
|volume=166
|issue=3
|pages=1375–83
|pmid=15082556
|pmc=1470796
|doi=10.1534/genetics.166.3.1375
|url=http://www.genetics.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=15082556
|author=Yu, N.
|access-date=2015-12-12
|archive-date=2019-12-15
|archive-url=https://web.archive.org/web/20191215101925/http://www.genetics.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=15082556
|dead-url=no
}}</ref>。

可通過直接比對DNA序列來算出核苷酸多樣性，亦可使用用分子標記得出的數據（比如使用隨機擴增多態性DNA（RAPD）技術或擴增片段長度多態性PCR（AFLP-PCR）得出的數據）推算出<ref>{{cite journal
|title=Estimating nucleotide diversity from random amplified polymorphic DNA and amplified fragment length polymorphism data
|journal=Molecular Phylogenetics and Evolution
|date=January 2001
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|last=
|volume=18
|issue=1
|pages=143–8
|pmid= 11161751 |doi=10.1006/mpev.2000.0865
|url=
|author=Borowsky, Richard L.}}</ref><ref>{{cite journal
|title=A method for estimating nucleotide diversity from AFLP data
|journal=Genetics
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|last= |author2=Ryohei Terauchib Günter Kahlb |author3=Fumio Tajima
|volume=151
|issue=3
|pages=1157–64
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|author=Innan, Hideki
|date= March 1, 1999
|pmc=1460529 }}</ref>。

==註釋==
{{reflist|group=註}}

==參考==
{{Reflist}}

==外部連結==
*[http://seqanswers.com/forums/showthread.php?t=33639 一個計算核苷酸多樣性的教程] {{Wayback|url=http://seqanswers.com/forums/showthread.php?t=33639 |date=20200124122512 }}

[[Category:分子遺傳學]]