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[[File:Stohrem.jpg|thumb|结晶固体:[[钛酸锶]]的原子分辨率图像。 较亮的原子是[[锶]],而较暗的原子是[[钛]]。]] '''晶体学''',又称'''结晶学'''({{lang-en|Crystallography}}),是一门以确定[[固体]]中[[原子]](或[[离子]])排列方式为目的的[[实验科学]]。“晶体学”一词原先仅指对各种晶体性质的研究,但随着人们对[[微观]]尺度上的认识加深,其词义已大大扩充。 在[[X射线]][[衍射]]晶体学提出之前(介绍见下文),人们对[[晶体]]的研究主要集中于晶体的[[点阵]]几何上,包括测量各[[晶面]]相对于理论参考[[坐标系]](晶体坐标轴)的夹角,以及建立晶体点阵的[[对称性|对称]]关系等。夹角的测量用[[测角仪]]完成。每个晶面在三维空间中的位置用它们在一个立体球面坐标“网”上的投影点(一般称为投影“[[极(晶体学)|极]]”)表示。坐标网的又根据不同取法分为<U>Wolff网</U>和<U>Lambert网</U>。将一个晶体的各个晶面对应的极点在坐标网上画出,并标出晶面相应的[[密勒指数]],最终便可确定晶体的对称性关系。 现代晶体学研究主要通过分析晶体对各种[[电磁波]]束或[[粒子]]束的衍射图像来进行。辐射源除了最常用的X射线外,还包括[[电子]]束和[[中子]]束(根据[[德布罗意]]理论,这些基本粒子都具有'''波动性''',参见条目[[波粒二象性]]),可以表现出和光波类似的性质)。晶体学家直接用辐射源的名字命名各种标定方法,如'''[[X射线衍射]]'''(常用英文缩写XRD),'''[[中子衍射]]'''和'''[[电子衍射]]'''。 以上三种辐射源与晶体学试样的作用方式有很大区别:X射线主要被原子(或离子)的最外层[[价电子]]所[[散射]];电子由于带负电,会与包括[[原子核]]和[[核外电子]]在内的整个空间电荷分布场发生相互作用;中子不带电且质量较大,主要在与原子核发生碰撞时(碰撞的概率非常低)受到来自原子核的作用力;与此同时,由于中子自身的[[自旋]][[磁矩]]不为零,它还会与原子(或离子)[[磁场]]相互作用。这三种不同的作用方式适应晶体学中不同方面的研究。 ==基本理论== {{凝聚体物理学}} 普通显微成像的原理是利用[[光学]]透镜组汇聚来自待观测的物体的[[可见光]],进行多次成像放大。然而,可见光的[[波长]]通常要远大于固体中[[化学键]]的[[键长]]和[[原子]]尺度,难以与之发生[[物理光学]]作用,因此晶体学观测学要选择波长更短的辐射源,如X射线。但一旦使用短波长辐射源,就意味着传统的“显微放大”和“实像拍摄”方法将不能(或难以)应用到晶体学研究中,因为自然界没有材料能制造出可以汇聚短波长射线的[[透镜]]。所以要研究固体中原子或离子(在晶体学中抽象成[[点阵]])的排列方式,需要使用间接的方法——利用晶格点阵排列的空间周期性。 晶体具有高度的[[有序性]]和[[周期性]],是分析固体微观结构的理想材料。以X射线衍射为例,被某个固体原子(或离子)的外层电子散射的X射线[[光子]]太少,构成的辐射强度不足以被仪器检测到。但由晶体中满足一定条件([[布拉格定律]]的多个晶面上的原子(或离子)散射的X射线由于可以发生相长[[干涉]],将可能构成足够的强度,能被照相[[底片]]或[[感光]]仪器所记录。 ==各种表示方法== {{main|密勒指数}} * 晶体中的'''[[晶向]]'''用'''方括号'''括起的三个最小[[互质]][[坐标]]值来标出,譬如:'''<nowiki>[100]</nowiki>'''; * 在对称操作中等价的一组晶向称为'''[[晶向族]]''',用'''尖括号'''括起的三个最小互质坐标值来标出,譬如<math> <100> </math>。在[[正方晶系]]中,上述晶向族中包含的晶向有<math>[100], [010], [001], [\bar{1}00], [0\bar{1}0], [00\bar{1}]</math>六个晶向; * '''[[晶面]]'''的密勒指数用'''圆括号'''括起,如'''(100)'''。在正方晶系中,(hkl) 晶面垂直于 [hkl] 晶向; * 与晶向族的定义类似,在对称操作中等价的一组晶面称为'''[[晶面族]]''',用'''花括号'''括起,如'''<nowiki>{100}</nowiki>''' 。 ==实验技术== 晶体学研究的某些材料,如[[蛋白质]],在自然状态下并非晶体。培养蛋白质或类似物质晶体的典型过程,是将这些物质的水[[溶液]]静置数天、数周甚至数月,让它通过[[蒸发]]、[[扩散]]而结晶。通常将一滴溶有待结晶物质分子、[[缓冲剂]]和[[沉淀剂]]的水溶液置于一个放有[[吸湿剂]]的密封容器内,随着水溶液中的水慢慢蒸发,被吸湿剂吸收,水溶液浓度缓慢增加,[[溶质]]就可能形成较大的结晶。如果溶液的浓度增加速度过快,析出的溶质则为大量取向随机的微小颗粒,难以进行研究。 晶体获得后,便可以通过衍射方法对其进行研究。尽管当今许多大学和科研单位均使用各种小型X射线源进行晶体学研究,但理想的X射线源却是通常体积庞大的[[同步加速器]]([[同步辐射]]光源)。同步辐射X射线[[波谱]]宽、强度和准直度极高,应用于晶体学研究可大大提高精确度和研究效率。 从晶体的衍射花样推测晶体结构的过程称为'''衍射花样的标定''',涉及较繁琐的数学计算,常常要根据和衍射结果的比较对模型进行反复的修改(该过程一般称为modeling and refinement)。在这个过程中,晶体学家要计算出可能晶格结构的衍射花样,并与实际得到的花样进行对比,综合考虑各种因素后进行多次筛选和修正,最终选定一组(通常不止一种)与实验结果最大程度吻合的猜测作为推测的结果。这是一个异常繁琐的过程,但如今由于[[电脑]]的广泛应用,标定工作已经大大简化了。 除上述针对晶体的衍射分析方法外,[[纤维]]和[[粉末]]也可以进行衍射分析。这类试样虽然没有单晶那样的高度周期性,但仍表现出一定的有序度,可利用衍射分析得到其内部分子的许多信息。譬如,[[DNA]]分子的双螺旋结构就是基于对纤维试样的X射线衍射结果的分析而提出,最终得到验证的。 ==应用== ===在材料科学中的应用=== 晶体学是[[材料科学]]家常常使用的研究工具。若所要研究物质为单晶体,则其原子排布结构直接决定了晶体的外形。另外,结晶材料的许多[[物理]]性质都极大地受到晶体内部[[晶格缺陷|缺陷]](如杂质原子、[[位错]]等等)的影响,而研究这些缺陷又必须以研究晶体结构作为基础。在多数情况下,研究的材料都是多晶体,因此[[粉末衍射]]在确定材料的微观结构中起着极其重要的作用。 除晶体结构因素外,晶体学还能确定其他一些影响材料物理性质的因素。譬如:[[黏土|粘土]]中含有大量细小的鳞片状矿物颗粒。这些颗粒容易在自身平面方向作相对滑动,但在垂直自身平面的方向则极难发生相对运动。这些机制可以利用晶体学中的[[织构]]测量进行研究。 晶体学在材料科学中的另一个应用是'''[[相态|物相]]分析'''。材料中不同[[化学成分]]或同一种化学成分常常以不同[[相态|物相]]的形式出现,每一相的原子结构和物理性质都不相同,因此要确定或涉及材料的性质,相分析工作十分重要。譬如,纯[[铁]]在加热到912℃时,晶体结构会发生从[[体心立方]](body-centered cubic,简称bcc)到[[面心立方]](face-centered cubic,简称fcc)的相转变,称为[[奥氏体]]转变。由于面心立方结构是一种密堆垛结构,而体心立方则较松散,这解释了铁在加热过912℃后体积减小的现象。典型的相分析也是通过分析材料的X射线衍射结果来进行的。 晶体学理论涉及各种空间点阵对称关系的枚举,因此常需借助[[数学]]中的[[群论]]进行研究。参见[[对称群]]。 ===在生物学中的应用=== [[X射线晶体学]]是确定[[生物大分子]],尤其是[[蛋白质]]和[[核酸]](如[[DNA]]、[[RNA]])[[构象]]的主要方法。DNA分子的双螺旋结构就是通过晶体学实验数据发现的。1958年,科学家(Kendrew, J.C. et al.)首次通过研究生物大分子的[[晶体结构]],利用X射线分析方法得到了[[肌红蛋白]]分子的空间模型(Nature 181, 662–666)。 如今,研究人员已建立起了[[蛋白质数据库]]([[蛋白質資料庫]],PDB),将已测明的蛋白质和其他生物大分子的结构供人们免费查询。利用[[蛋白质结构]]分析[[软件]][[RasMol]]或[[Pymol]],还可对生物分子结构数据进行可视化。 [[中子衍射技术|中子射线晶体学]]可以与[[X射线晶体学]]互补,获得[[X射线晶体学]]中经常缺失的生物大分子[[氢原子]]位置的信息。 {{le|电子晶体学|Electron crystallography}}应用在某些蛋白质,如[[膜蛋白]]和[[衣壳|病毒壳体蛋白]]结构的研究中。 ==相关科学家== * [[威廉·阿斯特伯里]](1898-1961) * [[J·D·伯纳尔|约翰·德斯蒙德·伯纳尔]](1901-1971) * [[唐·克雷格·威利]]({{lang|en|Don Craig Wiley}}) * [[勒内·朱斯特·阿维]](1743—1822) * [[威廉·哈洛斯·密勒]]({{lang|en|William Hallowes Miller}}) * [[奥古斯特·布拉菲]] * [[威廉·亨利·布拉格]] * [[威廉·劳伦斯·布拉格]] * 格伦·h·布朗({{lang|en|Glenn H. Brown}}) * [[罗伯特·胡贝尔]] * [[多萝西·克劳福特·霍奇金]] * [[马克斯·佩鲁茨]] * [[伊莎贝拉·卡乐]](Isabella Karle,1921-2017) ==参见== {{Portal|地球科学}} {{colbegin}} * [[原子堆垛因子]] * [[晶体]] * [[晶体光学]] * [[雏晶]] * [[结晶过程]] * [[晶体学群]] * [[衍射]] * [[衍射的动力学理论]] * [[粉末衍射]] * [[电子晶体学]] * [[对称群]] * [[X射线晶体学]] {{colend}} ==参考资料== * 冯端、丘第荣编,《金属物理学》第一卷《结构与缺陷》,科学出版社,北京,1987,ISBN 7-03-006431-3 * 周玉、武高辉编,《材料分析测试技术》,哈尔滨工业大学出版社,哈尔滨,1998,ISBN 7-5603-1338 * 刘孝敏编著,《工程材料的微细观结构和力学性能》,中国科学技术大学出版社,合肥,2003,ISBN 7-312-01572-7 *新药发现开发技术平台,2007年版,高等教育出版社, ISBN 978-7-04-022039-1 * 罗谷风编,《结晶学导论》, 地质出版社,2010,ISBN 978-7-116064881 ==外部链接== {{commonscat|Crystallography}} * [https://web.archive.org/web/20060826015700/http://www.rockhounds.com/rockshop/xtal/index.html 晶体学和矿物结晶系统介绍(英文)] * [https://web.archive.org/web/20080417001743/http://www.iucr.ac.uk/iucr-top/comm/cteach/pamphlets.html 晶体学教学小册子(英文)] * [https://web.archive.org/web/20080324193801/http://cst-www.nrl.navy.mil/lattice/spcgrp/ 晶体的点阵结构(英文)] * [https://web.archive.org/web/20060830065044/http://www.ccp14.ac.uk/ 免费的晶体学软件] * [http://www.ccp4.ac.uk/ 蛋白质晶体学软件包] {{Wayback|url=http://www.ccp4.ac.uk/ |date=20070623055237 }} * [http://sourceforge.net/projects/tclab/ 相变晶体学计算软件PTCLab] {{Wayback|url=http://sourceforge.net/projects/tclab/ |date=20140714153255 }} {{地质学}} {{Authority control}} {{DEFAULTSORT:J}} [[Category:化学分支]] [[Category:凝聚体物理学]] [[Category:晶体学|*]] [[Category:仪器分析]] [[Category:材料科学]]
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